Режим, близкий к заповедному, на территории пущи был установлен в начале XV в. Сначала была запрещена охота, в 1588 г. был издан лесной устав, который запрещал рубку даже мертвых деревьев. Сохранению пущи способствовало то, что в ней обитали зубры, вымирание которых и желание сохранить в Европе этот вид побуждало сперва литовских князей, потом польских королей, а позднее русских царей ревностно заботиться об охране этого леса. С 1775 года Беловежская пуща является охотничьим хозяйством русских царей. В 1802 году был издан Указ о заповедании пущи и сохранении зубров. Проводилась регулярная подкормка и учет зубров, но численность их постоянно сокращалась. В 1865 году сюда завезены благородные олени для реакклиматизации. За время войн в пуще вырублено 4,5 млн. м3 древесины, однако несмотря на это, здесь сохранились участки девственного леса. С 1939 года в пуще установлена полная заповедность. Свою деятельность заповедник возобновил в октябре 1944 года, но уже только в восточной советской ее части. В 1957 году заповедник был преобразован в заповедно-охотничье хозяйство. С 1991 года Беловежская пуща стала национальным парком. В 1992 году она занесена в список Мирового наследия человечества. В 1993 году парку присвоен международный статус биосферного заповедника. С целью сохранения биологического разнообразия Беловежской пущи, вся территория ее разделена на 4 функциональные зоны с различным режимом охраны: заповедная зона - зона нетронутой природы, где запрещаются все виды хозяйственной и иной деятельности, за исключением научных исследований и охраны (15677 га в основном коренных естественных старовозрастных хвойно-широколиственных лесов); зона регулируемого пользования - 57000 га (все мероприятия в этой зоне должны обеспечивать оптимальные условия для развития природных экосистем с целью сохранения и эволюционного развития генофонда растительного и животного мира); рекреационная зона - 10712 га (ландшафты зоны отличаются высокими эстетическими санитарно-гигиеническими свойствами и предназначены для ознакомления с достопримечательностями парка, организованного познавательного туризма, рекреации и изучения рекреационных нагрузок на экосистемы); хозяйственная зона - 3969 га (предназначена для размещения объектов административного и рекреационного назначения, приема и обслуживания туристов, проживания и осуществления хозяйственной деятельности сотрудников парка). Кроме того, вокруг парка создана, так называемая, охранная или буферная зона площадью около 90 тыс. га, где земли сохраняются за пользователями, но имеется ряд ограничений хозяйственной деятельности. Национальный парк Беловежская пуща - это крупная природная научная лаборатория, которая привлекает к себе ученых из многих стран.